Posso excluir determinadas palavras-chave de serem substituídas?

O Pretty Links não oferece suporte nativo a esse recurso, mas há uma maneira de fazer isso com bastante facilidade.

Se você entrar no modo Texto da sua página ou publicação ao editá-la e substituir um caractere na(s) palavra(s) que não deseja que seja(m) substituída(s) pelo valor HTML ASCII desse caractere, o Pretty Links não deverá vê-lo como uma correspondência, mas a palavra ainda aparecerá normalmente na página.

Certifique-se de salvar a página enquanto ainda estiver no modo Texto. Se você voltar ao modo Normal, o editor TinyMCE WYSIWYG usado pelo WordPress converterá o caractere ASCII de volta ao normal.

Então, digamos que você queira substituir um "x" na palavra Chemex. Você entraria no modo de edição de texto e encontraria a instância dessa palavra no conteúdo que não deseja substituir - e a alteraria para Chemex. O x é a representação ASCII do caractere "x" minúsculo. Você pode encontrar uma referência completa aqui: http://www.w3schools.com/tags/ref_ascii.asp.